白洋淀乌鳢线粒体D-Loop区序列遗传多样性分析

doi:10.3969/j.issn.1000-1565.2014.02.015

摘要/Abstract

摘要： 采集白洋淀野生鸟鳢(Channa argu)群体和养殖乌鳢群体62个样本.运用PCR技术对该62个样本的线粒体D-Loop区序列进行扩增,测序得到的序列进行比对.结果显示,线粒体D-Loop区片段中,T,C,A和G碱基平均含量分别为28.14％,22.36％,34.38％和15.12％,A+T的含量(62.52％)高于G+C含量(37.48％),具有明显的碱基组成偏向性.共检测到112个变异位点,占全部序列的12.3％,检测到单倍型9种,单倍型多样性(Hd)为0.783,核苷酸多样性(Pi)为0.054 09,2个群体的遗传距离为0～0.12,遗传分化指数(Fst)为0.943 44,基因流(Nm)为0.014 99.基于线粒体D-Loop区序列的研究表明:野生乌鳢群体的遗传多样性比养殖群体的遗传多样性低,同时2群体间具有明显的遗传分化现象.

关键词: 乌鳢, 线粒体D-Loop区, 养殖, 野生, 遗传多样性

Key words: Channa argu, mitochondrial D-Loop, culture, wild, genetic diversity

中图分类号:

Q346.5

董新培,穆淑梅,周楠,康现江,白俊杰. 白洋淀乌鳢线粒体D-Loop区序列遗传多样性分析[J]. 河北大学学报(自然科学版), 2014, 34(2): 201-206.

DONG Xinpei,MU Shumei,ZHOU Nan,KANG Xianjiang,BAI Junjie. Genetic diversity of mitochondrial DNA D-Loop sequences of Channa argu in Baiyangdian[J]. Journal of Hebei University (Natural Science Edition), 2014, 34(2): 201-206.

参考文献

[1] 姜海. 白洋淀区域环境问题研究 [D]. 天津大学 2003.
[2] 李小勤, 刘贤敏, 冷向军, 王锡昌, LI Xiao-Qin, LIU Xian-Min, LENG Xiang-Jun, WANG Xi-Chang. 盐度对乌鳢(Channa argus)生长和肌肉品质的影响 [J]. 海洋与湖沼 2008.doi:10.3321/j.issn:0029-814X.2008.05.012
[3] 吴莉芳, 张东鸣, 黄权, 陈勇, 刘新宇, WU Li-fang, ZHANG Dong-ming, HUANG Quan, CHEN Yong, LIU Xin-yu. 乌鳢的生长模型和生活史类型研究 [J]. 吉林农业大学学报 2000.doi:10.3969/j.issn.1000-5684.2000.02.022
[4] 周义斌. 乌鳢生物学特性及其高效养殖技术 [J]. 江西水产科技 2006.doi:10.3969/j.issn.1006-3188.2006.03.012
[5] 陈四海, 区又君, 李加儿, Chen Sihai, Ou Youjun, Li Jiaer. 鱼类线粒体DNA及其研究进展 [J]. 生物技术通报 2011.
[6] 邹习俊, 韩雪, 韩虎峰. 鱼类mtDNA及其非编码区的研究概况 [J]. 贵州畜牧兽医 2009.doi:10.3969/j.issn.1007-1474.2009.03.009
[7] 温晓曦, 孙效文, WEN Xiao-xi, SUN Xiao-wen. 乌鳢微卫星DNA分子标记的分离及筛选 [J]. 大连水产学院学报 2010.doi:10.3969/j.issn.1000-9957.2010.03.014
[8] 刘苏, 朱新平, 陈昆慈, 赵建, 潘德博, 李凯彬, Liu Su, Zhu Xinping, Chen Kunci, Zhao Jian, Pan Debo, Li Kaibin. 斑鳢、乌鳢及其杂交种遗传差异的AFLP分析 [J]. 基因组学与应用生物学 2010.doi:10.3969/gab.029.000673
[9] 黄志坚, 徐晓鹏, 唐晶晶, 张飓, 郑锦卿, 李桂峰, 何建国, HUANG Zhijian, XU Xiaopeng, TANG Jingjing, ZHANG Ju, ZHENG Jinqing, LI Guifeng, HE Jianguo. 淡水鱼类线粒体DNA D-loop基因的引物设计和应用 [J]. 中山大学学报（自然科学版） 2009.doi:10.3321/j.issn:0529-6579.2009.04.018
[10] 刘焕章. 鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化:以鳑鱼类为例 [J]. 自然科学进展 2002.doi:10.3321/j.issn:1002-008X.2002.03.008
[11] 毛勇, 蒋秋芬, 曾华嵩, 王军, MAO Yong, JIANG Qiu-fen, ZENG Hua-song, WANG Jun. 大黄鱼线粒体DNA控制区遗传多样性分析 [J]. 厦门大学学报（自然科学版） 2010.
[12] 刘海林, 章群, 唐优良, 余帆洋, 周佳怡, LIU Hai-lin, ZHANG Qun, TANG You-liang, YU Fan-yang, ZHOU Jia-yi. 黄渤海松江鲈鱼线粒体控制区结构与序列多态性分析 [J]. 海洋通报 2010.doi:10.3969/j.issn.1001-6392.2010.03.008
[13] 陈竹, 钟山, 罗大极, 杨国华, 梁日深, 邹记兴, CHEN Zhu, ZHONG Shan, LUO Da-Ji, YANG Guo-Hua, LIANG Ri-Shen, ZOU Ji-Xing. 基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性 [J]. 水生生物学报 2011.doi:10.3724/SP.J.1035.2011.00761
[14] 杨博, 陈小勇, 杨君兴, YANG Bo, CHEN Xiao-yong, YANG Jun-xing. 鱇(鱼良)白鱼线粒体DNA控制区结构和种群遗传多样性分析 [J]. 动物学研究 2008.doi:10.3321/j.issn:0254-5853.2008.04.005
[15] 赵春龙, 肖国华, 罗念涛, 远全义, 邓鹏春. 白洋淀鱼类组成现状分析 [J]. 河北渔业 2007.doi:10.3969/j.issn.1004-6755.2007.11.017
[16] 韩希福, 王所安, 曹玉萍. 白洋淀重新蓄水后鱼类组成的生态学分析 [J]. 河北渔业 1991, 6.
[17] PARISET L, MARIOTTI M, GARGAN1 M. Genetic diversity of sheep breeds from albania, greece, and italy assessed by mitochondrial DNA and nuclear polymorphisms (SNPs) [J]. The Scientific World Journal 2011, 11.
[18] KNAUS B J, CRONN R, LISTON A. Mitochondrial genome sequences illuminate maternal lineages of conservation concern in a rare carnivore [J]. BMC Ecology 2011, 11(01).
[19] SACCONE C, ATTIMONELLI M, SBISA E. Structural elements highly preserved during the evolution of the D-loopcontaining region in vertebrate mitochondrial DNA [J]. Journal of Molecular Evolution 1987, 26(03).
[20] WILKINSON G S, CHAPMAN A M. Length and sequence variation in evening bat D-loop mtDNA [J]. GENETICS 1991, 128(03).
[21] 刘改艳, 陈昆慈, 郑光明, 朱新平, 赵建, 徐鹏, 孙效文, LIU Gai-yan, CHEN Kun-ci, ZHENG Guang-ming, ZHU Xin-ping, ZHAO Jian, XU Peng, SUN Xiao-wen. SSR-BSA技术对乌鳢性别差异标记的初步筛选 [J]. 水产学报 2011.doi:10.3724/SP.J.1231.2011.17112
[22] NEIGEL J E, AVISE J C. Application of a random walk model to geographic distributions of animal mitochondrial DNA variation [J]. GENETICS 1993, 135(04).
[23] 彭士明, 施兆鸿, 侯俊利, PENG Shi-ming, SHI Zhao-hong, HOU Jun-li. 基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性 [J]. 水产学报 2010.doi:10.3724/SP.J.1231.2010.06384
[24] PRIOLI A J, CARLO V A, SORIA T V. Mitochondrial D-loop nucleotide diversity in Astyanax (Osteichthyes, Characidae) from the upper Paraná and upper Paraguay River basins [J]. Genetics and Molecular Research 2012, 11(02).